杭州个体工商户的税种主要包括增值税、企业所得税和个人所得税。

首先，杭州个体工商户需要缴纳的税种之一是增值税。根据国家相关规定，从事生产经营活动的个人或家庭，在中华人民共和国境内销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及应税服务，应当依法缴纳增值税。个体工商户作为独立核算的经济实体，其销售货物和提供应税服务的行为属于增值税的征税范围之内；同时，个体工商户还需要按照规定的税率计算并缴纳相应的增值税。

其次，杭州个体工商户还需缴纳企业所得税。企业所得税是对企业的所得额进行征税的一种税种。对于个体工商户来说，如果其符合一定的条件，可以成立一家有限责任公司或股份有限公司等形式的企业，从而享受企业所得税的优惠政策。个体工商户需要根据其收入情况，按照国家规定的比例计算并缴纳企业所得税。

最后，杭州个体工商户还需要缴纳个人所得税。个人所得税是针对个人的所得额进行的征税，包括工资薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得等。对于个体工商户而言，其主要收入来源为营业收入，因此需要按照规定缴纳个人所得税。

综上所述，杭州个体工商户的主要税种包括增值税、企业所得税和个人所得税。这些税种不仅关系到个体工商户自身的财务状况，也对其经营活动产生重要影响。