如果两个公司希望合作注册一个新的公司，可以考虑以下步骤：

　　1.协商合作意向：两个公司首先需要协商并达成合作意向，明确合作的目标、范围、责任分工等。

　　2.筹备合作协议：制定合作协议，明确双方的权益、义务、合作方式等。建议寻求法律专业人士的帮助，确保协议的合法性和有效性。

　　3.注册新公司：根据当地的法律和规定，选择一个合适的公司名称，并按照相关程序注册新的合作公司。注册程序可能包括填写申请表格、提供必要的文件和资料，支付注册费用等。

　　4.股权分配：根据合作协议，确定两个公司在新公司中的股权比例和分配方式。

　　5.公司运营：注册完成后，新公司可以开始正式运营。根据合作协议，双方公司可以共同参与公司的管理和决策。

　　请注意，合作注册公司涉及到法律、财务等多个方面的问题，建议您咨询专业的律师、会计师或商务注册机构，以确保合作过程的合规性和顺利进行。